MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510a

Total Repeats: 40159

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_013855	CAG	2	6	1450066	1450071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960864
40002	NC_013855	AGC	2	6	1450100	1450105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960864
40003	NC_013855	CGG	2	6	1450161	1450166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40004	NC_013855	CCGG	2	8	1450172	1450179	0 %	0 %	50 %	50 %	288960864
40005	NC_013855	CCT	2	6	1450221	1450226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288960864
40006	NC_013855	GCC	2	6	1450229	1450234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960864
40007	NC_013855	CCCCG	2	10	1450264	1450273	0 %	0 %	20 %	80 %	288960864
40008	NC_013855	GTC	2	6	1450282	1450287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960864
40009	NC_013855	CAG	2	6	1450312	1450317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960864
40010	NC_013855	CGA	2	6	1450365	1450370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960864
40011	NC_013855	CGA	2	6	1450428	1450433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960864
40012	NC_013855	GC	3	6	1450466	1450471	0 %	0 %	50 %	50 %	288960864
40013	NC_013855	CGG	2	6	1450537	1450542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40014	NC_013855	GCC	2	6	1450643	1450648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960864
40015	NC_013855	CGG	2	6	1450661	1450666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40016	NC_013855	CGG	2	6	1450673	1450678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40017	NC_013855	CGT	2	6	1450686	1450691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960864
40018	NC_013855	GCG	2	6	1450706	1450711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40019	NC_013855	TGA	2	6	1450715	1450720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288960864
40020	NC_013855	CACG	2	8	1450740	1450747	25 %	0 %	25 %	50 %	288960864
40021	NC_013855	GCG	2	6	1450774	1450779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40022	NC_013855	GGC	2	6	1450783	1450788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40023	NC_013855	AGGA	2	8	1450868	1450875	50 %	0 %	50 %	0 %	288960864
40024	NC_013855	GCG	2	6	1450905	1450910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40025	NC_013855	GA	3	6	1450920	1450925	50 %	0 %	50 %	0 %	288960864
40026	NC_013855	GGC	2	6	1450971	1450976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40027	NC_013855	GCA	2	6	1450995	1451000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960864
40028	NC_013855	CGG	2	6	1451017	1451022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960864
40029	NC_013855	ATGG	2	8	1451038	1451045	25 %	25 %	50 %	0 %	288960864
40030	NC_013855	CGC	2	6	1451059	1451064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960865
40031	NC_013855	TCC	2	6	1451065	1451070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288960865
40032	NC_013855	GCG	2	6	1451104	1451109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40033	NC_013855	GGC	2	6	1451124	1451129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40034	NC_013855	CGG	2	6	1451144	1451149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40035	NC_013855	AGG	2	6	1451156	1451161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288960865
40036	NC_013855	CCG	2	6	1451177	1451182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960865
40037	NC_013855	GC	4	8	1451201	1451208	0 %	0 %	50 %	50 %	288960865
40038	NC_013855	GCC	2	6	1451217	1451222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960865
40039	NC_013855	CGC	2	6	1451267	1451272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960865
40040	NC_013855	CGG	4	12	1451309	1451320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40041	NC_013855	GGGCGG	2	12	1451327	1451338	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	288960865
40042	NC_013855	GCG	3	9	1451377	1451385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40043	NC_013855	G	6	6	1451393	1451398	0 %	0 %	100 %	0 %	288960865
40044	NC_013855	GCC	2	6	1451452	1451457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960865
40045	NC_013855	CGGGC	2	10	1451535	1451544	0 %	0 %	60 %	40 %	288960865
40046	NC_013855	CGCGG	2	10	1451552	1451561	0 %	0 %	60 %	40 %	288960865
40047	NC_013855	GGC	2	6	1451565	1451570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40048	NC_013855	ACC	2	6	1451581	1451586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288960865
40049	NC_013855	GCC	2	6	1451594	1451599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960865
40050	NC_013855	AAG	2	6	1451613	1451618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288960865
40051	NC_013855	CCG	2	6	1451619	1451624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960865
40052	NC_013855	TCC	2	6	1451638	1451643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288960865
40053	NC_013855	CCGG	2	8	1451675	1451682	0 %	0 %	50 %	50 %	288960865
40054	NC_013855	GCG	2	6	1451704	1451709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40055	NC_013855	GCCG	2	8	1451726	1451733	0 %	0 %	50 %	50 %	288960865
40056	NC_013855	GGC	3	9	1451734	1451742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40057	NC_013855	GGC	2	6	1451844	1451849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40058	NC_013855	CGT	2	6	1451853	1451858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960865
40059	NC_013855	CCG	2	6	1451941	1451946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960865
40060	NC_013855	GCC	3	9	1451970	1451978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960865
40061	NC_013855	CCA	2	6	1451996	1452001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288960865
40062	NC_013855	CAG	2	6	1452057	1452062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960865
40063	NC_013855	GC	3	6	1452066	1452071	0 %	0 %	50 %	50 %	288960865
40064	NC_013855	GCG	2	6	1452079	1452084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960865
40065	NC_013855	GAC	2	6	1452144	1452149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960865
40066	NC_013855	TGC	2	6	1452155	1452160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960865
40067	NC_013855	TGCCC	2	10	1452188	1452197	0 %	20 %	20 %	60 %	288960865
40068	NC_013855	GGC	2	6	1452218	1452223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40069	NC_013855	GGC	2	6	1452254	1452259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40070	NC_013855	AGCC	2	8	1452265	1452272	25 %	0 %	25 %	50 %	288960866
40071	NC_013855	CG	3	6	1452278	1452283	0 %	0 %	50 %	50 %	288960866
40072	NC_013855	CCG	2	6	1452314	1452319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40073	NC_013855	CGGT	2	8	1452363	1452370	0 %	25 %	50 %	25 %	288960866
40074	NC_013855	CGT	2	6	1452403	1452408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40075	NC_013855	TCG	2	6	1452448	1452453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40076	NC_013855	C	6	6	1452454	1452459	0 %	0 %	0 %	100 %	288960866
40077	NC_013855	TCG	2	6	1452526	1452531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40078	NC_013855	GGC	2	6	1452650	1452655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40079	NC_013855	CAG	2	6	1452656	1452661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40080	NC_013855	GGCC	2	8	1452667	1452674	0 %	0 %	50 %	50 %	288960866
40081	NC_013855	CCG	2	6	1452727	1452732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40082	NC_013855	CAG	2	6	1452734	1452739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40083	NC_013855	TGG	2	6	1452757	1452762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288960866
40084	NC_013855	TGT	2	6	1452781	1452786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288960866
40085	NC_013855	CGG	2	6	1452824	1452829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40086	NC_013855	CGG	2	6	1452836	1452841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40087	NC_013855	CCG	2	6	1452856	1452861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40088	NC_013855	AGCAC	2	10	1452868	1452877	40 %	0 %	20 %	40 %	288960866
40089	NC_013855	CTC	2	6	1452899	1452904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288960866
40090	NC_013855	GGT	2	6	1452977	1452982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288960866
40091	NC_013855	GCCG	2	8	1453017	1453024	0 %	0 %	50 %	50 %	288960866
40092	NC_013855	GCC	2	6	1453061	1453066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40093	NC_013855	TCC	2	6	1453092	1453097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288960866
40094	NC_013855	CTC	2	6	1453115	1453120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288960866
40095	NC_013855	GCC	2	6	1453131	1453136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40096	NC_013855	CGC	2	6	1453138	1453143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40097	NC_013855	CGG	2	6	1453153	1453158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40098	NC_013855	CGGT	2	8	1453170	1453177	0 %	25 %	50 %	25 %	288960866
40099	NC_013855	CCGCG	2	10	1453222	1453231	0 %	0 %	40 %	60 %	288960866
40100	NC_013855	GCA	2	6	1453252	1453257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40101	NC_013855	CCA	2	6	1453342	1453347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288960866
40102	NC_013855	G	6	6	1453351	1453356	0 %	0 %	100 %	0 %	288960866
40103	NC_013855	CGG	2	6	1453357	1453362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40104	NC_013855	CGG	2	6	1453366	1453371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40105	NC_013855	TCG	2	6	1453428	1453433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40106	NC_013855	AGCGC	2	10	1453491	1453500	20 %	0 %	40 %	40 %	288960866
40107	NC_013855	ACG	2	6	1453504	1453509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40108	NC_013855	GCCAGC	2	12	1453566	1453577	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288960866
40109	NC_013855	GCC	2	6	1453594	1453599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40110	NC_013855	GCG	2	6	1453612	1453617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40111	NC_013855	CCT	2	6	1453624	1453629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288960866
40112	NC_013855	CCG	2	6	1453630	1453635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40113	NC_013855	GCC	2	6	1453674	1453679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40114	NC_013855	CGG	2	6	1453707	1453712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40115	NC_013855	TCG	2	6	1453785	1453790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40116	NC_013855	CG	3	6	1453805	1453810	0 %	0 %	50 %	50 %	288960866
40117	NC_013855	GCC	2	6	1453815	1453820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40118	NC_013855	TCCA	2	8	1453829	1453836	25 %	25 %	0 %	50 %	288960866
40119	NC_013855	CCG	2	6	1453924	1453929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40120	NC_013855	GCC	2	6	1453940	1453945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40121	NC_013855	GCCG	2	8	1453951	1453958	0 %	0 %	50 %	50 %	288960866
40122	NC_013855	CAC	2	6	1453970	1453975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288960866
40123	NC_013855	CTC	2	6	1453976	1453981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288960866
40124	NC_013855	GCC	2	6	1454005	1454010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40125	NC_013855	GCG	2	6	1454026	1454031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40126	NC_013855	GCC	2	6	1454058	1454063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40127	NC_013855	CAG	2	6	1454084	1454089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40128	NC_013855	CGG	2	6	1454091	1454096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40129	NC_013855	CGGC	2	8	1454098	1454105	0 %	0 %	50 %	50 %	288960866
40130	NC_013855	TGCA	2	8	1454142	1454149	25 %	25 %	25 %	25 %	288960866
40131	NC_013855	GCG	2	6	1454173	1454178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40132	NC_013855	CCCG	2	8	1454179	1454186	0 %	0 %	25 %	75 %	288960866
40133	NC_013855	CCGG	2	8	1454222	1454229	0 %	0 %	50 %	50 %	288960866
40134	NC_013855	GGC	2	6	1454240	1454245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40135	NC_013855	CGC	2	6	1454288	1454293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40136	NC_013855	CGC	2	6	1454306	1454311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40137	NC_013855	AG	4	8	1454338	1454345	50 %	0 %	50 %	0 %	288960866
40138	NC_013855	CCG	2	6	1454374	1454379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40139	NC_013855	GCC	3	9	1454445	1454453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40140	NC_013855	GCG	2	6	1454464	1454469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40141	NC_013855	GCG	2	6	1454493	1454498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40142	NC_013855	CGC	2	6	1454513	1454518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40143	NC_013855	CTC	2	6	1454519	1454524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288960866
40144	NC_013855	CCG	2	6	1454533	1454538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40145	NC_013855	CAG	2	6	1454543	1454548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40146	NC_013855	CGC	2	6	1454717	1454722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40147	NC_013855	TGA	2	6	1454742	1454747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288960866
40148	NC_013855	CAG	2	6	1454765	1454770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40149	NC_013855	TG	3	6	1454775	1454780	0 %	50 %	50 %	0 %	288960866
40150	NC_013855	CT	3	6	1454828	1454833	0 %	50 %	0 %	50 %	288960866
40151	NC_013855	GGT	2	6	1454834	1454839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288960866
40152	NC_013855	CGG	2	6	1454841	1454846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40153	NC_013855	CGGGC	2	10	1454858	1454867	0 %	0 %	60 %	40 %	288960866
40154	NC_013855	CG	3	6	1454893	1454898	0 %	0 %	50 %	50 %	288960866
40155	NC_013855	CGC	2	6	1454989	1454994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40156	NC_013855	TCG	2	6	1454998	1455003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288960866
40157	NC_013855	GCG	2	6	1455004	1455009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866
40158	NC_013855	CCG	3	9	1455017	1455025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288960866
40159	NC_013855	GGC	2	6	1455033	1455038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288960866

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.